本剧讲述1937年南京(⏫)大屠杀的四十九日里发生的故事。日本军队进入沦陷(🉑)的南京城，奉命掩埋中国死难士(🚤)兵和战俘尸体。与此同时，市(🏺)中心的圣马德(🐰)伦教堂中迎来了一群不速之客，十来个女学生(❓)和秦淮河女子，她们殊(🛅)途同(🔨)归只为同一件事――逃难。紧接着许(🖋)多男人也因为各(🙇)种原因(📡)进(🌰)入了教堂。围墙外的日军寻找各种借口进入教堂，圣马德伦教堂的后院成(😣)为他们填埋尸体掩盖罪证的目标，国际(🍭)安全区的组织者尝试各种解救教堂被困人员的方案，却屡屡失败。教堂中的男人们为了保护藏在教堂阁楼和地窖中的女人，献出了自己的生命，女人(🚂)们或者选择了有尊严地死去，或者进行了最壮烈的抵抗。在这四十九个日夜里，他们和她们，在一次次地求生、抵抗、毁灭和复活中缔结了爱情、亲情和友(🕯)情，曾懦弱地变成了勇士、(😩)曾迷失的找到了方向、曾虚无的得到了收获、曾有罪的完成了救赎。