本剧讲述1937年南京大屠杀的四十九日里发生的故事。日本军队进入沦陷的南京城，奉命掩埋中国死难士兵和战俘尸体。与此同时，市中心(☕)的圣马德伦教(🗓)堂中迎来了一群不速之客，十来个女学生和秦淮河女子，她们(🥫)殊途同归只(🤟)为同一件事――逃难。紧接着许多男人也因为各种原因进入了教(👌)堂。围墙外的日军寻找各种借口进入教堂(🎞)，圣马德伦教堂(🚗)的后院成为他们填埋尸(🍜)体掩盖罪证的目标，国际安全区的组织者尝试(🌨)各种解救教堂被困人员的方案，却屡屡失败(🎒)。教堂中的男人们为了保护藏在教堂阁(🚃)楼和地窖中的女人，献出了自己的生命(🐗)，女人们或者选择了有尊严(🦍)地死去，或者进行了最壮烈的抵抗。在这四十九个日夜里，他们和她们，在一次次地求生、抵抗(🧖)、毁灭和复活中缔结了(🤪)爱情(🍍)、亲情和友情，曾(📇)懦弱地变成了勇士、曾迷失(🐢)的找到了方向、曾虚无的得到了收获、曾有罪的完成了救赎。